A FEAGRI é constituída de Comissões, Conselhos Integrados e da Congregação.

As Comissões são órgãos que coordernam e administram as atividades de sua respectiva área de atividade:

• COMISSÃO DE PÓS-GRADUAÇÃO: Comissão que coordenada e administra as atividades dos Curso de Pós-Graduação da faculdade.
  
• COMISSÃO DE GRADUAÇÃO: Comissão que coordenada e administra as atividades de ensino do Curso de Graduação da faculdade.
  
• COMISSÃO DE EXTENSÃO: Comissão responsável pela elaboração das diretrizes e coordenação das atividades de Extensão da faculdade.
• COMISSÃO DE PESQUISA: Comissão que tem como objetivo Principal traçar diretrizes para incentivar e apoiar a ação da Faculdade no campo da pesquisa.
  

Os Conselhos Integrados (antigos Departamentos) são unidades que integram a infra-estrutura e recursos humanos da faculdade agrupando em temas técnico-científicos.

• CIIR (Conselho Integrado de Infra Estrutura Rural): são agrupadas as áreas de produção agropecuária, tanto vegetal como animal, buscando sustentabilidade, e soluções por meio de maquinário e de otimização de sistemas.
• CITP (Conselho Integrado de Tecnologia de Processos): são agrupadas as áres de Tecnologia Pós-colheita, Saneamento Ambiental e Produção de Biocombustíveis.
• CIPG (Conselho Integrado de Planejamento e Gestão): são agrupadas as áreas de Gestão de Sistemas Agrícolas, do Desenvolvimento Rural Sustentável e das Construções Rurais.
• CONEST (Conselho Estratégico): é o conselho responsável pelo planejamento e a gestão estratégica da faculdade, assim como análise da proposta orçamentária, entre outros escopos administrativos.

A CONGREGAÇÃO é o maior órgão deliberativo da faculdade, compete a ele fazer a elaboração da listra para escolha do Diretor,  criação ou extinção dos Conselhos Integrados, criação, extinção ou fusão das Áreas de Concentração, Laboratórios, Núcleos Internos, aprovação dos relatórios de atividade, entre outros escopos legislativos superiores da faculdade.

Representantes Discentes

Nossos atuais representantes discentes das comissões são:

• COMISSÃO DE GRADUAÇÃO: Eduardo Minoro Sato (titular)
•  COMISSÃO DE PÓS-GRADUAÇÃO: Luna Valentina Ângulo Arias (titular), Frederico Reinaldo Correa de Queiroz (suplente)
•  COMISSÃO DE PESQUISA: Rafaella Pironato Amaro (titular)
• COMISSÃO DE EXTENSÃO: Carmem Ap. Herrera (pós-graduação)

Nossos atuais representantes discentes dos conselhos integrados são:

• CONS. INT. TEC. E PROCESSOS: Raysa Maduro Alves (titular), Viviane de Souza Silva (suplente)
• CONS INT PLANEJAMENTO E GESTÃO: Rachel Scrivani da Silva (pós-graduação)
• CIIR não há representantes, pois não houve inscritos
• CONEST: Frederico Reinaldo Correa de Queiroz (pós-graduação)

Nossos atuais representantes discentes titulares da Congregação são:

• Leonardo Valentino Soares (pós-graduação)
• Rachel Scrivani da Silva (pós-graduação)
• Isabela Helena Bratfischer (graduação)
• Vitor Gonçalves da Silva (graduação)

Os representantes discentes suplentes da Congregação são:

• Carmen Ap Herrera (pós-graduação) 
  
• Cecilia Lira Melo de Oliveira (pós-graduação) 
• Fernando Lombardi Barbarossa (graduação)
• Samantha Freire Mendes (graduação)