Subordinada à Diretoria da Faculdade, a Seção de Protótipos tem como missão oferecer suporte técnico à comunidade acadêmica na construção de protótipos e na execução de experimentos necessários para ensaios de campo e de laboratório.
A Seção está equipada com recursos voltados à área metal-mecânica, abrangendo usinagem, caldeiraria e acabamento. Sua infraestrutura permite atender às demandas das diversas áreas da Faculdade, apoiando atividades de ensino, pesquisa e extensão, em especial aquelas desenvolvidas por docentes nos cursos de graduação e pós-graduação.
Também atua diretamente no apoio às aulas práticas, possibilitando que os estudantes tenham contato com peças, equipamentos e seus processos de montagem e desmontagem. Além disso, a Seção desempenha papel fundamental no desenvolvimento de projetos de pesquisa, contribuindo com a construção de protótipos e a realização de experimentos envolvendo o teste de dispositivos mecânicos relacionados à engenharia agrícola.